מרי יצחק כהן נולד, להערכתי, בסוף המאה הי"ח, או לכל המאוחר בתחילת המאה הי"ט. הוא היה ראב"ד ורב העיר עדן בשנת תרי"ט (1859) בזמן ביקורו של ר"י ספיר בתימן. הוא כותב עליו, כי בשנה זו "הרב הזקן חסיד ועניו מורי יצחק כהן נ"י, והוא סגי נהור זה מקרוב - ה' יאיר עיניו, והרב הישיש מרי מנחם בונינו נ"י והרב הישיש וקציר מרי שמואל דיין נ"י".
משמע, שבשנה זו היה זקן אולי כבן שישים - שבעים שנה, ראשון בחכמי עדן, וכנראה, ראב"ד ורב ראשי. היה סגי נהור. קהילת עדן מנתה אז כמאתיים וחמישים משפחות, מן הערים הגדולות ביותר בתימן.