מרי זכריה בן יעקב היה חכם במרכז תימן ואולי אף בצנעא במאה הי"ט.
הוא, כנראה, חיבר ספר העוסק בליקוטים לתורה ומוסר עפ"י תורת הקבלה. הוא ידוע מתוך חיבורו של מרי דוד בן שלום ג'מאל-גמליאל - חפץ דוד, העוסק בליקוטים לתורה ורעיונות מוסר והנהגה. הוא מזכיר רבים מחכמי תימן בדורו, וכשמגיע לשמו של מרי זכריה בן יעקב הוא כותב "נר"ו" (=נצרו רם ונשא), משמע שהיה בין החיים באמצע המאה הי"ט.